Michel Goya naît le 19 avril 1962 à Montaut. Après des études littéraires, il intègre l’armée de terre en 1983. Entré en 1988 à l’École militaire interarmes de Saint-Cyr Coëtquidan, il en sort major de la promotion Valmy en 1990. Il est nommé lieutenant en 1990. À sa sortie, il choisit l’arme des troupes de marine. Au sein de ce corps, il est déployé sur de multiples théâtres d’opérations où il exerce des fonctions de commandement clé (notamment à Sarajevo et en République Centrafricaine lors de l’opération Cigogne). En 2009, il est promu au grade de colonel.